入東漢後，由於桓譚批評、反對當時朝野盛行的神學圖讖說，故而仕途坎坷，不斷碰壁，隻做過“議郎”“六安郡丞”之類的小官，最後被貶出京。在東漢時，他根本沒有入蘭台、太卜查閱國家藏書的資格。他能入蘭台、太卜，當在王莽朝任掌樂大夫時。因為太史、太卜、掌樂大夫同為太常屬官，蘭台藏書正歸太史所管。近水樓台不難得月。故《新論》所言蘭台、太卜藏易書之事，必在西京之時。
然而，劉歆校書編目，太史令尹鹹分校數術書。蘭台、太卜之藏書正在其列。若此二處藏有《連山》《歸藏》，劉歆、尹鹹作為校書當事人豈有不知之理。《七略》及其改編本《漢誌》焉能不載。筆者一點也不懷疑桓譚會憑空編造，譚是一個有氣節的學者，其言之鑿鑿，又不象“戲說”。這究竟是怎麽一迴事。看來隻能作如下解釋：《連》《歸》究竟有何內容，當時大家都不得而知。譚又篤信新問世的古經《周禮》的“三易”之說。於是他便把當時蘭台、太卜所藏的一種有八萬字、一種有四千三百字的、皆是以六十四卦為載體的非《周易》的筮書——例如，錄入《漢誌·數術略·蓍龜類》中的《大衍筮》、《大次雜易》或錄入《六藝略·易類》中的《古雜》八十篇中的某些篇章——推定其為《連山》《歸藏》而與劉歆相異。這種做法正符合其本傳所說，譚“尤好古學，數從劉歆、楊雄辨析疑異”的學術個性。況且上引的三句話，均出自《新論·正經》篇。所謂“正經”，即訂正經書也。據此篇名即可見譚必認為當時列為官學的“經書”也有誤漏之處，需要訂正。當時《周易》兩篇，另有七種共十篇《傳》均被尊之為經，而這與《周禮》之“三易”說並不相符。於是譚從國家藏書中找出了另外兩種被視為雜占的書尊之為《連山》《歸藏》而補全“三易”之數，這是一項重大的“正經”工作，譚是完全有可能這麽做的。可惜，桓子《新論》除個別章、句外，全書早在五代時就已亡佚了，無從得知其認定《連山》《歸藏》之理由了。然而《漢誌》的作者班固，則應該非常理解和熟悉桓子《新論》的。據桓譚本傳記載，班固曾奉章帝詔續補過《新論》。班固曾任蘭台令史並撰《漢書》，他至少對漢代蘭台太卜是否收藏過《連山》《歸藏》是瞭解的。然而班固寧可“三易”缺二，也不在其所著《漢誌》中補入譚所指的《連山》與《歸藏》易。可見，漢蘭台太卜藏有《連山》《歸藏》之說，隻是桓譚個人標新立異之見，是不足為據的。
《易經》成書不晚於西周。據《左傳》莊公二十一年、閔公二年記載的陳公子完少時與魯公子友將生時求筮之例可知，早在春秋初期人們已普遍應用《周易》的卦爻辭與卦象作預測了。而號稱與《周易》並列“三易”，並擺在《周易》之前的《連山》《歸藏》卻似存似無。從春秋初年算起，下迄西晉統一全國時長達千餘年內，除戰國時的《周禮》對《連山》《歸藏》二易作過簡略至極的介紹，從而東漢人據以稱引《歸藏》之名外，不僅《歸藏》的文字不見書目、誌史著錄，其文字連一句也不見諸子百家的征引。
《連山》，亦稱《連山易》，為《周易》的衍生物。《周禮》：“太卜掌三易之法，一曰連山易，二曰歸藏，三曰周易。其經卦皆八，其別皆六十有四。”其中連山易和歸藏易成為華夏文化的千古之謎。有人以為，連山易是以艮卦開始，如山之連綿，故名連山。
鄭玄在《易讚》中說：“《連山》者，象山之出雲，連連不絕。”其是以艮卦開始，如山之連綿，故名連山。《連山》與《歸藏》、《周易》並稱為“三易”，《連山》屬先天易。東漢學者桓譚在《新論正經》中說：“《連山》八萬言，《歸藏》四千三百言。”
《連山》是以四季六氣為旺衰指引，以六甲值符為吉兇判辨之坐標，以三元九運為時空轉換。不同於用金、木、水、火、土五行生剋的客觀論來指導概念論的辯證方法。其先天八卦圖，以艮山為首，主要講陰陽卦的對峙。
《連山易》古多隻稱《連山》，其名初見於《周禮·春官·宗伯·大卜》：“掌三《易》之法：一曰《連山》，二曰《歸藏》，三曰《周易》。其經卦皆八，其別皆六十有四。”
其《筮人》又雲：“筮人掌三《易》，以辨九筮之名：一曰《連山》，二曰《歸藏》，三曰《周易》。”
“連山”義為山出內氣，山連山。
鄭玄《周禮注》：“名曰連山，似山出內氣也。”
《易讚》、《易論》：“連山者，象山之出雲連連不絕。”
賈公彥疏：“名曰連山，似山出內氣也者，此連山易，其卦以純艮為首，艮為山，山上山下是名連山，雲氣出內於山，故名易為連山。”
《三國誌·魏誌·高貴鄉公傳》：“連山似山出內氣，連天地也。”
後世也有人以為《連山》不是易。“連山、歸藏非易也。而雲易者，後人因易之名以名之也。”顧炎武之說沒有過硬依據。
《周禮?春官?大卜》：“掌三易之法，一曰連山。二曰歸藏，三曰周易。”
鄭玄於《周禮注》稱：“名曰連山，似山出內氣也。”
關於《三易》之說。《周禮》“掌三易之法，一曰《連山》，二曰《歸藏》，三曰《周易》，其經卦皆八，其別卦六十有四”。
《連山》是用古人對客觀世界的實體論、摸看論來定義萬物發展的自然法則，對以人為本的社會人類行為作了係統的規則並論證論述。
《連山易》中的內容在滲入古代醫學文獻的同時，還有可能竄向堪輿風水雜學之中，人們將其發揮運化，用於觀山說水、擇宅選墳，逐漸演變出一些有關峰嶺骨象、地氣結穴、藏風得水，虎踞龍盤之說。
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