中醫運用陰陽對立統一的觀念來闡述人體上下、內外各部分之間，以及人體生命同自然、社會這些外界環節之間的複雜聯係。陰陽對立統一的相對平衡，是維持和保證人體正常活動的基礎；陰陽對立統一關係的失調和破壞，則會導致人體疾病的發生，影響生命的正常活動。
五行學說，五行學說是華夏古代哲學的重要成就。五行學說即是用木、火、土、金、水五個哲學範疇來概括客觀世界中的不同事物屬性，並用五行相生相剋的動態模式來說明事物間的相互聯係和轉化規律。五行學說中以五髒配五行，即：肝與木、心與火、脾與土、金與肺、水與腎。五髒與五行相生相剋應保持相對平衡和穩定，和諧相處。如果五髒與五行發生失調，出現太過、不及或反侮，也會致疾病的發生，這對於推斷疾病的好轉和惡變，治療方法，提供了充足依據。中醫主要運用五行學說闡述五髒六腑間的功能聯係以及髒腑失衡時疾病發生的機理，也用以指導髒腑疾病的治療。
五行於中醫則體現了具備這五種屬性的人體五大係統的相互關係。木火土金水這五個符號分別代表肝心脾肺腎所統領的五大係統。中醫不是研究微觀的病毒細菌如何作用於人體的理論而是研究人體整體的各個係統之間的關係，並且通過中藥、按摩、針灸，甚至心理作用去調節各個係統之間的平衡，以此保持身體健康。
五行的互動作用包括：相生、相剋、製化、勝複、相侮、相乘、母子相及。
氣血津液，氣血津液是構成人體的基本物質，是腑髒、經絡等組織器官進行生理活動的物質基礎。
氣是構成人體和維護人體生命活動的最基本物質，在生理上具有推動、溫煦、防禦、固攝、氣化等功能。氣聚合在一起便形成了有機體，氣散則形體滅亡。莊子說：“通天下一氣耳”，全天下就是一個氣。有了這個氣就運動，就生生不息，就變化不止，沒有這口氣就完了。
血是構成人體和維持人體生命活動的基本物質，具有很高的營養和滋潤作用。血必須在脈中執行，才能發揮它的生理作用。血在脈中迴圈執行，內至腑髒，外達皮肉筋骨，不斷對全身各腑髒組織器官起著充分的營養和滋潤作用，維持人體正常的生理活動。
津液是指各腑髒組織器官的內在體液及正常分泌物，是機體一切正常水液的總稱。津和液的性狀功能及分佈部位各有不同，津是指性質較清稀，流動性較大，分佈於體表麵板肌肉，並能滲注於血脈，起著滋潤的作用。液是指性質較稠厚，流動性較小，流注於骨節、腑髒、腦髓等組織，起著濡養作用。
氣血津液都是機體腑髒、經絡等組織器官進行生理活動所需要的能量，而氣血津液又依賴於腑髒、經絡等組織器官正常的生理活動。如果氣血津液代謝不正常或腑髒、經絡等組織器官不能進行正常的生理活動，就會引起疾病的發生。
髒腑學說，髒腑學說主要是研究五髒心、肝、脾、肺、腎、六腑小腸、大腸、胃、膀胱、膽、三焦和奇恆之腑腦、髓、骨、脈、膽、女子胞的生理功能和病理變化。
藏：指人體內的五髒六腑、奇恆之府，通稱為髒腑。象：一指“形象”，即髒腑的解剖型態；二指“征象”，即髒腑表現於外的生理病理；三指“應象”，即髒腑相應於四時陰陽之象。
透過外在“象”的變化，以測知內在“藏”的生理病理狀態，稱為“從象測藏”。即“視其外應，以知其內髒”。
“髒腑”不單是解剖型態的概念，而是包括解剖、生理、病理在內的綜合概念。
五髒：指肝、心、脾、肺、腎，一般籠統功能為“化生和儲藏精氣”。
六腑：指膽、胃、大腸、小腸、膀胱、三焦，一般籠統功能為“腐熟水榖、分清泌濁、傳化糟粕”。
奇恆之府：指“腦、髓、骨、脈、膽、女子胞”。
氣血津液，氣、血、津液是構成和維持人體生命活動的基本物質。
氣的生成源自先天與後天。稟受於父母的精氣，稱為“先天之氣”。肺吸入自然的清氣，與脾胃運化水榖產生的水榖之氣，合稱為“後天之氣”。
氣有推動、溫煦、防禦、固攝、氣化、營養等作用。
人體的氣可分為元氣、宗氣、營氣、衛氣、髒腑之氣、經絡之氣。
氣的“升降出入”運動失常，稱為“氣機不調”。其表現形式有氣滯、氣鬱、氣逆、氣陷、氣脫、氣閉等。
經絡學說，針灸學及腧穴。
經絡是人體執行氣血、聯絡髒腑形體官竅、溝通上下內外的通道。
經絡係統包括十二經脈、十二經別、奇經八脈、十五別絡、浮絡、孫絡、十二經筋、十二皮部等。
經絡在中醫學的重要性正如《扁鵲心書》所說：“學醫不知經絡，開口動手便錯。蓋經絡不明，無以識病證之根源，究陰陽之傳變。”
經脈學說，經絡學說是研究人體經絡的生理功能、病理變化與髒腑相互關係密切的學說。經絡被定義為人體內執行氣血的通道，起溝通內外，網路全身的作用。在病理情況下，經絡係統功能發生變化，會呈現相應的症狀和體征，通過這些表現，可以診斷體內髒腑疾病。
病因學說，《黃帝內經》將病因分為陰陽兩類：“生於陽者，得之風雨寒暑”，“生於陰者，得之飲食、居處、陰陽、喜怒”。
漢代張仲景在《金匱要略》中，把病因分為三類：“經絡受邪入髒腑，為內所因”，“四肢九竅，血脈相傳，壅塞不通，為外麵板所中”，“房室、金刃、蟲獸所傷”。
宋代陳無擇提出“三因學說”：外所因、內所因、不內外因。
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