至南宋，神霄派在江南地區十分流行。有稱傳自王文卿者，有稱傳自林靈素者，有稱傳自張繼先者。虞集《正侍宸記》謂王文卿於南宋初飛升後，得其傳者，唯新城高子羽，子羽傳臨江徐次舉，次舉傳金溪聶天錫，天錫傳臨川譚悟真，人稱譚五雷。入元後，譚悟真仍活動於人間。宋洪邁《夷堅丙誌》卷十四雲：建昌王文卿既以道術著名，其徒鄭道士得其五雷法，往來筠、撫諸州，為人請雨治祟，召呼雷霆，若響若答。
南宋理宗時道士劉玉為《神霄金火天丁**》作《後序》，記有林靈素所傳一係，稱：“火師傳與玉真教主林侍宸，林傳與張如晦，後傳陳道一，下付薛洞真，盧君野。次以神霄派脈付徐必大，徐亦不得其文，盧君化於劍江，將解，而枕中出其書以付玉。法傳盧君，而派繼徐君。”
《道法會元》卷二百五十三《地緒餘論》又記張繼先所傳一係，稱：“地一司之法，實起教於虛靖天師，次顯化於天寶洞主王宗敬真官，青城吳道顯真官，青州柳伯奇仙官，果州威惠鍾明真人，相繼而為宗師。其後如江、浙、閩、蜀、湖廣，嗣法者何限，姓名昭揭寧幾人。”以上所列諸人的事跡皆不詳。
南宋時期的金丹派南宗亦兼傳神霄五雷法。白雲蟾《翠虛陳真人得法記》稱，火師汪真君命其弟子辛忠義傳法給陳楠，陳楠傳之白玉蟾。《海瓊白真人語錄》卷一曰：“真師告元長曰：……曏者天真遣狼牙猛吏雷部判官辛漢臣授之先師陳翠虛，翠虛以授於我，今以付子，子宜秘之。”《道法會元》卷一百四《高上景霄三五混合都天大雷琅書》所列師派即為：玉清聖境元始法王，玉清真王長生大帝，……火師真君汪康民，辛忠義，陳楠，白玉蟾。《道法會元》卷八十三《先天雷晶隱書》所列師派稍有不同，為：
李亞，汪守真，王文卿，白玉蟾、金逵……。說明南五祖之陳楠、白玉蟾確係神霄雷法的重要傳人。
由上可見，南宋時期傳習神霄雷法的支派甚多，神霄派在當時傳法頗盛。不僅如此，當時各個支派中又隨時分衍出若幹小支係，使該派的傳衍既盛且雜。《道法會元》卷二百五十三《地緒餘論》稱，起於虛靖天師的地*一法，傳至後來，“則有蘇道濟派，溫州正派，李蓬頭派，遇矅卿派，玄靈續派。如此等類，數之不盡。千蹊萬徑，源析之分，使學者莫之適從。”明張宇初說：“神霄則雷霆諸派始於玉清真王，而火師汪真君闡之。次而侍宸王君、虛靜真君、西河薩君、伏魔李君、樞相許君。倡其宗者，林靈素、徐神翁、劉混康、雷默庵、萬五雷、方貧樂、鄧鐵岩；而上官、徐、譚、楊、陳、唐、莫而下，派亦衍矣。”又稱“神霄自汪、王二師而下，則有張、李、白、薩、潘、楊、唐、莫諸師，恢弘猶至。凡天雷、酆嶽之文，各相師授，或一將而數派不同，或一派而符咒亦異，以是訛舛失真，隱真出偽者多，因而互生謗惑。”可見神霄派在南宋時期傳播十分繁盛，但也十分雜亂。
入元以後，傳林靈素、張繼先者轉衰，傳王文卿者較盛。
其主要傳人為莫月鼎。吳興人。約生於南宋理宗寶慶年間，飛升於明成祖至明末。初從四川青城山丈人觀徐無極受五雷法，繼聞鄒鐵壁得王文卿斬勘雷書，秘不傳，乃委身童隸事之，終獲受其書。於是“召雷雨，破鬼魅，動與天合。
雖嬉笑怒罵，皆若有神物從之者”。明成祖曾召見試其術“有驗”，有旨令掌道教事，以老耄辭，遂給驛南旋。此後，佯狂避世，浪跡江湖。莫月鼎之弟子甚眾，但所得王文卿之秘籍，一如鄒鐵壁，不輕易授人，因此得其真傳者，唯王繼華與潘無涯二人。後“繼華授張善淵，善淵授步宗浩，宗浩授周玄真。皆解狎雷致雨雲，而玄真尤號偉特”。周玄真，字玄初，世居嘉禾，後遷姑蘇。從步宗浩受五雷秘文後，祈雨治疾，頗有奇驗，享譽於宋末之際，明初飛升。前引虞集《靈惠衝虛通妙真君王侍宸記》又記王文卿所傳高子羽一係，傳至譚悟真時，已由宋入明。後譚悟真傳廬陵羅虛舟，虛舟再傳蕭雨軒、周立禮二人。周傳其子，蕭則傳胡道玄。道玄，鄱陽人，人稱“神霄野客”，行道於關、陝、荊、襄、江、漢、淮、海、閩、浙之間。此外，又有金善信，字實之，吳之長洲人，曾得莫月鼎不傳之秘，被三十八代天師張與材起為廣德路道錄，明室賜號體仁守正弘道法師。
還有王惟一亦傳莫月鼎之學。王惟一，號景陽子，括蒼人。
其所著《道法心傳》稱，曾得莫月鼎和鄒鐵壁之秘法。該書對雷法多所闡揚。
明代神霄派除莫月鼎一係十分昌盛外，還有其他一些支係同時活動。《曆世真仙體道通鑒續編·莫月鼎傳》雲：莫月鼎“與同郡西野沈震雷真人同師事鐵壁鄒真人”。“自侍宸王真君演道以來，惟真人與西野沈真人二派支流衍迤，盛於西江，昌於東吳。”即莫、沈兩係皆分別傳衍於蘇、浙、贛、閩、廣等地。唯沈震雷一係不見其他記載，故未得其詳。
入明以後，仍有神霄道士的活動。除前述莫月鼎一係傳至周玄真，享譽於宋明之際外，又有周思得顯名於永樂間。據錢謙益《列朝詩集》載，周思得，字養真，錢塘人。“行靈官法，先知禍福。文皇帝北征，召扈從，數試之不爽。招弭祓除，祈雨禬兵，鹹如影響。乃命祀靈官神於宮城西，……思得曆事五朝，年逾九十，賜諡弘道真人”。
據《萬曆野獲補遺》卷四和《明史·禮誌》載，周思得所行靈官法，是薩守堅弟子王靈官傳下的。因周思得行之有驗，成祖乃封薩守堅為崇恩真君，王靈宮為隆恩真君，並建廟祀之。此後傳奉薩守堅道法的道士，繼續傳行，稱“西河派”，或“天山派”，其詳無考。
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