認為通過存思，天地之神可以進入人體，人體之神與天地之神混融，即可長生不老，飛登上清。上清派的存思、服氣、咽津、唸咒、佩符等修持方法，對道教齋醮儀式影響甚大。
《上清大洞真經》：簡稱《大洞真經》、《洞經》或《三十九章經》，上清派最早崇奉的主要經典，謂讀之萬遍即可成仙，被譽為“仙道之至經”。此經被上清派奉為諸經之首，比較典型地反映了上清派的修習方術。全書三十九章，以歌訣形式敘述存神法。此經在唐宋以前影響很大，後因內丹術之興起，影響漸衰。但經中的穴位名稱及氣血津液、人體結構觀念，多與傳統醫學相通，對研究道教的養生氣功有重要的參考意義。
《黃庭經》：上清派崇奉的另一重要經典，是一部以華夏醫學髒腑學說為理論基礎，認為人體百脈關竅各有主神，需用“存思”法以存守身神的修煉專著。《黃庭經》是前代修煉養生經驗的總結，又為後世的內修提供了基本理論和方法，被稱為“壽世長生之妙典”。
《上清大洞真經》是《上清經》的首卷，最早由南嶽魏華存傳給東晉句容人楊羲，後者於晉興寧二年用隸書將經卷寫出後傳給許謐、許翽。二人在原經文基礎上，進一步擴大經文篇幅，使得經文廣為流傳。北宋陳景元的《上清大洞真經玉訣音義》為《大洞真經》的代表性校釋本。《上清大洞真經》被視為道家“三奇第一之奇”，上清派奉此經為上清諸經之首，宣稱得到經書的人，可以不用修煉金丹，隻需將這本經書讀萬遍即可成仙。此經經文名中的“大洞”為上清家理想仙境，據稱此經本藏於大洞仙宮中，故名《大洞真經》。
第一卷為誦經玉訣，述修煉者誦詠《大洞真經》三十九章之前的存思禮儀，著重存思五方之氣、日月及二十四星。第二至第六卷為三十九章經，每章存思一神降臨修煉者身中某一部位，默唸祝咒，存呼神名，祈請其護衛。這是典型的道教上清派煉養方法，是《黃庭經》的延伸，對我們研究上清經係、上清派曆史及道教煉養學說都有一定的意義。收入《正統道藏》洞真部本文類。
上清有三十九帝皇，大道有《三十九章經》，人的身體中有三十九種部位，修煉若存思每章經之一神，神就能降臨保護修煉者的某一部位，“開生門”，“塞死戶”，這樣閉齋誦讀萬遍，就可以“乘雲駕龍，即日昇天”，躋身於虛幻仙境。朱校本分經為六卷。該經第一卷為《誦經玉訣》，講述修煉者在進齋室入定誦詠《大洞真經》三十九章之前的整套存思禮儀，包括叩齒、咽津、行、存思和咒祝，還記有《入室存思之圖》。存思包括三個方麵內容：首為存思五方之。五方指東南西北中五個不同的空間方位，即為氣。存思五方之的具體過程較複雜，其基本思想是以東南西北中五方為基礎，配以五行、五色、五髒的相應變化。
大致過程是，修煉者先分別朝東西南北中五方靜心閉目叩擊牙齒，默誦用於五方不同的咒語分別為《太帝君素語內咒》、《天帝君素語內咒》、《南極上元君素語內咒》、《後聖帝君素語內咒》、《太微天帝君素語內咒》，五方之顏色分別為青、赤、白、黑、黃。再分別引若幹次，口嚥唾液，讓精氣分別充入人身中肝、心、肺、腎、脾五髒，結成狀如木星、火星、金星、水星、土星之神。這種五方壇式結構方式，明顯受陰陽五行學術的影響，並與古靈寶《五篇真文》和《五符序》近似。其次為存思日月，主要內容是：“口及日月一息，分三九咽，結作二十七帝君”，其中“九帝不入絳宮，穿尾閭穴，上入泥丸；又九帝亦下穿絳宮，入下關之境；又九帝九中關之境。令日光使照一身，內徹泥丸，下照五髒腸胃之中，皆覺洞照於內外，令一身與日月之光合。
良久，叩齒，用‘嘻’字吐息。”其三，為存思二十四星，“此法每日行住坐臥，皆可修之。”主要過程是：“口吸二十四星一息，咽津二十四過，時覺吞一星從口中徑至臍中，又覺星光映照於一腹之內，洞徹五髒，又存星光化為二十四真人，並口吐黃如煙，以布臍中，鬱鬱然洞徹內外，良久，用‘呼’字吐息。”可見這些存思方法，充滿神奇的想象，對後世的氣功學有一定影響。
該經的卷二至卷六的三十九章經詳細地介紹修煉者存思的具體過程，每章分別記載神的名字和所鎮守的人身部位及其功能。修煉者在默誦具體章經時，先謹請某種神，再“真思”該神降生的不同顏色的真為神雲罩在修煉者的頭上；接著“次思”此神雲從泥丸中入，乃口吸神雲，吞津若幹次，則真結成數神，在人體內執行，通過具體的關竅，達到神所鎮守的部位，然後修煉者詠誦《大洞玉經》，默唸咒祝，想象佩帶各神的“消魔玉符”，“存呼”神的名字，請其發揮護衛功能，這便是每章經存思的大致過程。在三十九章之後，還有結經《徊風混合帝一秘訣》，指出修煉者在誦詠三十九章經之後，便應閉目存思這眾神白氣，混沌一團如白雲，從雲虛中來入口中，良久，從玉莖、兩腳底、兩手心中出去了良久，白忽又變成紫雲，從口入頭並入五髒之內，充滿腹內，過了較長時間，紫雲從兩腳底、兩手心、玉莖中透出；過一會兒，存見紫雲之充滿左右及一室之內，又想象口中出風吹紫雲之煙，互相混合纏繞，忽然結一位稱作“大洞帝一尊君”的仙；尊君嘴的左邊有日光，嘴的右邊有月光，嘴裏吐著徊風之，吹著日月之光，都變成白色和紫色之氣，讓光下滲入修煉者五髒六腑百節之內，一身之內，洞徹朗然，內外如白日那樣明亮，過了較久，忽然忘身，諸事完畢，神己定，覺得身體輕巧、神清氣爽，接著叩齒三十九遍，兩手試麵，再念頌咒，心拜四方，乃起，至此，三十九章存思的整個過程，始告結束。
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