下忍、中忍、上忍、唯有突忍習得所有忍術堪稱忍界第一修行者！
奈良：楠流、蒲生流、九州流、秀鄉流、飛鳥流。
長野：伊藤流、青木流、芥川流、戶隱流。
山形：羽黑流。新瀉加治流、上杉流。
和歌山：紀州流、根來流、奈賀流、新楠流、名取流。
廣島：福島流。
三重：澤流、瀧野流、內川流、義森流、瀧流、服部流、遷一務流、理極流、伊賀流。
愛知：全流、秋葉流。
山梨：忍甲流、忍光流、鬆田流、武田流、甲陽流。
櫪木：鬆本流、福智流。
岡山：備前流。滋賀甲賀流。
福井：義經流。
神奈川：北條流。
青森：中川流。
眾多流派在經歷了多年歷史長河與戰火的洗禮後，絕大部分流派已經失傳，剩下的隻有寥寥無幾的幾個流派仍在延續著這門獨特的戰爭藝術，不過令人感到欣慰的是，現今為數不多的流派中，已有流派拋棄原本不外傳的門戶之見，在為忍術成為世界的忍術而不懈努力著。伊賀，甲賀，紀伊，等叄州。其中後叄州的忍術在日本是最為發達的。
忍術教科書《萬川集海》，原本在大和民族東征之前，伊賀跟甲賀兩地是不分的，這裏都被稱作IGA。
後來因為在室町與戰國時代，這兩百年間地名分開，所以流派也慢慢分開啦！
不過雖然流派分開，可是忍者修練的經典卻是同一本書，這本書人們叫做《萬川集海》。這本書有著教導忍者如何施行忍術的一切理論基礎與技能。
伊賀與甲賀離京都跟名古屋算是很近，而且位在重山險阻圍繞的封閉小盆地裡，自成一個小天地。可是在戰略上的位置卻是十分的重要.因為靠近日本的中央近畿地帶，所以受到京都的文化影響蠻深的神社，寺院，莊園都很多.在後來莊園製度崩壞的時候，土豪們就一個個崛起在戰國時代，這麼小的土地居然有60個土豪，但是因為土地都很小，所以大家都想奪取對方的土地，於是每家人家大概都會養個30-40個兵，以便對付“敵國”.這裏的競爭是超乎外人想像的激烈，土豪們互相結盟，互相探查敵情，也互相屠戮，被打擊的土豪一但垮了，就很難再爬起，也難怪這種有山地，征戰又激烈的地方，會成為忍術發展的大本營。
忍術和其他武術流派強調體質訓練不同，它尤其強調精神上的修鍊，並將其整個的訓練體係，建立在超乎想像的精神修鍊基礎上。因為忍者所執行的大多是一去不回的高風險性任務，獨自一人在敵人的巢穴中完成任務要克服對死亡、孤獨、黑暗乃至於飢餓、寒冷、傷病等諸多困難，所以擁有強大的精神力量，是忍術之所以無堅不摧的真正原因。
作為一名忍者家族的後代，一經降生就必須接受殘酷的命運現實——或者成為忍者，或者死。忍者從很小的時候起，就被灌輸以對主人絕對忠誠的思想：除了自己的主人，任何人命令都不會聽哪怕是日本天皇也不行。通過從小開始這種精神洗腦而打造出的忍者比任何的宗教信徒都更加狂熱，更加無所畏懼。不過忍者也不是像邪教徒一樣的殭屍般的戰士，它有著一套切實可行的強大精神力量的訓練方法。這種技術纔是忍術的秘中之秘，它就是東密的修行。
東密和華夏的藏密，印度的雜密一樣，是佛教中密宗的一個支派，而且東密對於人體念力的開發，向來有著自己獨特的傳承，在密教界一直以顯著快捷著稱，忍者通過東密秘法的修習，錘鍊自己的意誌，精神變得無比純粹和堅韌，體內的潛能將得到最大限度的開發。可以完全除去心靈的迷惑和恐懼，全神貫注的投入戰鬥。此外密宗認為人的身體有許多奧秘和潛能，隻要通過密宗法門的不懈努力就能使修行者發揮全部潛力，讓身體與宇宙溝通達到天人和一的境界，這和忍者追求的極限體術不謀而合。密宗視大日如來為萬物之主，極力推崇傳承、真言和密咒。在一些影視作品或者漫畫中經常可以見到忍者做出許多古怪的手勢，那便是在表述東密主要修法之一的“九字秘印”：“臨、兵、鬥、者、皆、陣、列、在、前”這九字真言。
忍術對於身體訓練的強度也是非常殘忍的。忍術所包括的內容，每一項忍者都必須精通。並且每項訓練，都全是死亡淘汰賽，無法承受的人是不允許生存的。除了常規訓練外，忍術還包括多種“怪力訓練”，忍者通過它進一步磨練意誌，忍耐力，生存能力等等。這種怪力訓練諸如連續數天不食不動，殺死自己的同伴，以及與猛獸搏鬥等，是令人難以想像的。通過這些死亡率極高毫無人性的修行，忍者從精神到肉體都實現了超人的飛越。獲得了超越常人的毅力、耐力、戰鬥力。通過忍術的訓練而倖存的忍者，個個都是一部絕對可靠的全功率戰鬥機器。
幕府時代，忍者們乾出的離奇驚險、令人咋舌的事件舉不勝舉，熊野寺秘籍被毀一事，可窺一斑。
熊野寺的主持擁有一本日本武功的秘籍，從不示人，一個名叫上野守直的武士千方百計想得到它。忍者堀川奉令行動，他打聽出秘籍收藏在寺內一間小建築裡，寺廟戒備森嚴，無法進入。於是他花了七個月的時間，挖了一條地道通到小建築底下，這時才發現，該屋建在一塊大石頭上，根本無法挖通。可熊野寺主持已經發現有人在挖地道想盜秘籍，他派人在地道口突然用火攻，將堀川活活燒死。上野又派了另一名忍者八郎去盜秘籍。八郎長得年輕貌美，且能歌善舞，他被當作侍童招進寺裡，心術不正的僧侶將他打扮一番，當作同性戀的洩慾物件。
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