隋大業年間，平定楊玄感叛亂，數次鎮壓農民起義。隋煬帝南巡江都，委其鎮守長安。隋大業十三年，高祖起兵入關，屈突通奉代王楊侑之命堅守潼關，兵敗被俘，後降唐，授兵部尚書，封蔣國公，為秦王府行軍元帥長史。後隨李世民平定王世充，論功第一，拜陝東大行台右仆射，鎮守洛陽，後迴朝拜為工部尚書。
武德九年，李世民為爭奪皇位繼承權，率領秦王府親兵親將尉遲敬德、屈突通等發動了玄武門事變，殺了皇太子李建成。李世民當了皇帝，命屈突通以檢校行台仆射身份去鎮守洛陽。次年，授其為洛州都督，並加授左光祿大夫。貞觀二年，屈突通因年老患病卒於任，時年七十二歲。
屈突通之父屈突長卿，是北周的刺史。屈突通自幼性格剛直、堅毅，擅長騎射，且頗好武略。年輕時仕隋為虎牙郎將，後任右親衛大都督。
開皇十七年三月，屈突通任親衛大都督，奉隋文帝楊堅之命到隴西一帶巡查直屬朝廷的牧群。屈突通秉公執法，共查出兩萬多匹隱馬。隋文帝聞訊後大為震怒，欲將罪臣太仆卿慕容悉達及一千五百多名管事的官員全部處斬，屈突通於心不忍，便向隋文帝求情：“人命至重，人命至關重大，人死不能複生。陛下用最仁慈的政令撫育天下，難道容許因為牲畜財產而在一天之內殺戮一千五百人！臣鬥膽敢以死請命！”隋文帝怒視並且大聲斥責屈突通。屈突通繼續說：“臣情願自身受殺戮，來免除千餘人的死罪。”隋文帝此時方纔明白，於是說：“朕不明此理，竟然到這個地步。應當免除慕容悉達等人的死罪，表彰你的好建議！”於是免除了眾人的死罪。
經過這件事，屈突通在隋文帝心中留下了深刻的印象，日漸重用，升右武侯車騎將軍。屈突通為人正直，秉公辦事，即便是親屬犯法，也依法製裁，決不包庇寬容。當時他的弟弟屈突蓋任長安縣令，也以嚴整而知名。因此民間順口流傳：“寧食三鬥艾，不見屈突蓋，寧服三鬥蔥，不逢屈突通。”由此可見人們對他們的敬畏心理。
仁壽四年，隋文帝駕崩，太子楊廣即位，是為隋煬帝，授備身郎將、正議大夫。隋煬帝深知自己的皇位是采取了種種手段奪來的，幾個弟兄對他當皇帝都不滿意。為防止意外，隋煬帝決定將他們分別召迴京師，再做處理。隋煬帝便派屈突通持隋文帝璽書去晉陽征漢王楊諒入朝。原來隋文帝曾與楊諒秘密約定：“如果有璽書召你，驗看敕字加點，還要與玉麟符相合，那麽就能上路。”楊諒見到璽書與原約不能驗證，便知已經出事，於是盤問屈突通，屈突通閃爍其詞而不迴答，楊諒隻得將屈突通放迴長安，不久楊諒便起兵造反。大業七年，跟隨楊廣征討高句麗，升右光祿大夫、左武候衛將軍。
大業中期，屈突通轉任左驍衛大將軍。大業九年六月，司徒楊素之子楊玄感趁隋煬帝第二次征高麗之機，舉兵造反。由於楊玄感不善用兵，錯誤地攻打東都洛陽，結果遭到政府軍的頑強反擊。這時，遠在遼東的隋煬帝已率隋軍主力迴師，命虎賁郎將陳棱進攻據守黎陽的元務本，屈突通與左翊衛大將軍宇文述馳援東都洛陽。在東萊的來護兒也停止進攻高麗，還師西進，對包圍洛陽的楊玄感形成反包圍態勢。七月，楊玄感接受李子雄、李密的建議，率軍西進，準備奪取關中。待楊玄感軍到達閿鄉時，耽誤了寶貴的三天時間，此時屈突通、宇文述、衛文升、來護兒等各路隋軍已經追上，隋軍且戰且進，一日內三勝。八月，隋軍在皇天原與楊玄感決戰，大勝，楊玄感僅率十餘騎逃往上洛。楊玄感自知大勢已去，乃命楊積善將其殺死，起兵遂告失敗。屈突通以功遷左驍騎衛大將軍。
當時隋朝統治殘暴，各地紛紛起兵，而尤以秦、隴一帶為最。大業十年，延安人劉迦論據雕陰起兵反隋，自稱皇王，建元大世，其眾號稱十萬，與稽胡劉鷂子義軍呼應。隋煬帝任命屈突通為關內討捕大使，發關中兵進討。屈突通率軍進至延安，按兵不動，敵軍以為隋軍膽怯。屈突通則宣佈要撤兵，來放鬆敵人的警惕。同時，屈突通暗中率兵前往上郡。劉迦論不明敵情，率部南進，距屈突通軍七十裏紮營，分兵絢地。屈突通乘其無備，夜簡精甲襲之，斬殺劉迦論並起義軍萬餘。虜老弱數萬口，並於上郡南山築京觀，起義失敗。
此後，隋朝廷政治日益腐敗，各地農民不斷揭竿而起，而隋軍則軍無鬥誌，很多將領皆戰死。惟有屈突通與農民軍作戰時非常慎重，所以雖然沒有大捷，但是從沒戰敗過。
大業十二年，隋煬帝南下江都宮，令屈突通率部隨代王楊侑鎮守長安。
在全國農民起義的打擊下，隋王朝的統治已名存實亡。一些貴族豪強、地方官吏乘機起兵，割州據郡，稱公稱王，企圖利用農民戰爭戰果，取隋而代之。在這種形勢下，早有代隋之意的太原留守李淵及其子李世民亦於大業十三年五月，在太原宣告起兵。七月，以四子李元吉為鎮北將軍、太原太守，留守晉陽宮，負責太原事宜，自統甲士三萬於晉陽誓師出發，並發布檄文，告諭尊立隋代王楊侑之意。爾後沿汾水南下，經雀鼠穀，進屯賈胡堡。
代王楊侑派虎牙郎將宋老生率精兵二萬駐守霍邑，另派屈突通率驍果數萬駐守河東，與宋老生遙相呼應，以拒李淵。八月，李淵計誘宋老生出城，兩路夾擊，大敗隋軍，佔領霍邑，開啟了進軍關中通道。
李淵軍攻取霍邑後，沿汾水南下，占臨汾，克絳郡，於十五日進至龍門。
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