《淨明忠孝全書》全書六卷，卷一至卷五題“淨明傳教法師黃元吉編集，嗣法弟子徐慧校正”。卷六題“淨明法子玉隆陳天和編集，廬陵徐慧校正”。徐慧編輯淨明道諸位祖師傳記、神降法語及劉玉、黃元吉語錄，著成《淨明忠孝全書》六卷。劉玉羽化前以教事傳付弟子黃元吉。
元泰定二年，黃元吉去世，弟子陳天和編《中黃先生問答》為卷六。倡導儒道融貫，建樹淨明忠孝道的道書，六卷，明白雲霽《道藏目錄詳注》謂：“言淨明，隻是正心誠意，忠孝隻是扶持綱常。但學人習聞此語爛熟了，多是忽略過去，此間卻務真踐實履功夫，方與四字元契。且大忠者一物不欺，大孝者一體皆愛，淨者一物不染，明者一物不觸，不染不觸，忠孝自得。又日：忠者，忠於君也。心君為萬神之主宰，一念欺心，即不忠也。”《全書》卷首有元蔡國公知經筵事張畦、江南道禦史中丞趙世延、國子司業虞集、江西儒學提舉滕賓、國史院編修曾巽申、建昌路儒學教授彭塋序文，以鴻儒身份，讚稱淨明教旨切符儒家，有益世教。關於“淨明道”的基本義理，書中謂：“淨明者無幽不燭，纖塵不汙，愚智皆仰之，為開度之門，升真之路，以孝悌為之準式，修煉為之方術，行持之秘，要積累相資，磨礪智慧，而後道羆堅完，神人伏役，一瞬間可達玄理”。又：“淨明大教是正心修身之學，非區區世俗所謂修煉精氣之說也。正心修身是教世人整理性天心地工夫”，“貴在忠孝立本，方寸淨明，四美孝悌忠信俱備，神漸通靈，不用修煉，自然道成”。淨明道是正一道與南宋儒家理學相融貫而產生的道派，《淨明忠孝全書》即其立教旨綱。明《道藏》太平部“奉”學號收載。
淨明道是南宋初年西山道士何真公創立的道派。該道派源自靈寶派。其教義除傳行“淨明法”符籙外，還重心性和內丹的修煉，並力主以忠孝為本。何真公後嗣無人，其所創教派後來由玉真子劉玉重建並延續。
劉玉在羽化前將教事傳付給弟子黃元吉。黃元吉的弟子中，著名的有陳天和、徐慧、劉真傳、熊玄暉、劉思複、黃通理等人。繼黃元吉之後掌教的淨明宗師為徐慧，一名徐異，號丹扃道人。徐慧編輯了淨明道諸位祖師傳記、神降法語及劉玉、黃元吉語錄，最終著成《淨明忠孝全書》六卷。徐慧之後，淨明道的傳承法嗣便不明確。
淨明道祖師及傳人傳記前四篇為《淨明道師旌陽許真君傳》《淨明經師洪崖先生傳》《淨明法師洞真先生傳》《淨明監度師郭先生傳》，是許遜和“淨明三師”——張氳、胡慧超、郭璞的傳記，皆采擷前史和傳聞撰成，可資瞭解淨明道神仙譜係。《淨明忠孝全書》欲抬高張氳地位的意圖是很明顯的；而將兩“洪崖”相混，不過是欲借古“洪崖”之名望來提升唐張氳的形象罷了。唯自《淨明忠孝全書》始，方有張氳“嚐遇日月二君授以淨明靈寶忠孝之道”之說，並將其視為淨明道的“經師”。 後三篇即《西山隱士玉真劉先生傳》《中黃先生碑銘》《丹扃道人事實》，為淨明道宗師劉玉、黃元吉、徐異的傳記，述三人生平事跡較詳，是研究淨明道創教及傳承的重要文獻。其中，虞集相傳為南嶽真人轉世，與道教有著不解之緣，為黃元吉《淨明忠孝全書》作序，熟知許遜故事。
淨明道將忠孝作為立教宗旨，強調修煉仙道貴在忠孝立本，不用修煉自然道成。該書通過編纂許遜、胡慧超、張氳等祖師傳記來構建和傳達這一思想體係。
淨明道是南宋初年西山道士何真公創立，後由玉真子劉玉新建的淨明道延續下來，劉玉羽化前以教事傳付弟子黃元吉。黃元吉的弟子徐慧編輯淨明道諸位祖師傳記、神降法語及劉玉、黃元吉語錄，著成《淨明忠孝全書》六卷。元黃元吉《淨明忠孝全書》等對許遜事跡記載較為詳細，虞集為黃元吉《淨明忠孝全書》作序。
《淨明忠孝全書》等道教諸經在論及經義時，往往引孟子學說以闡述，其中關涉的道教與儒家孟子學說之關係是值得持續研究的學術問題。
《淨明忠孝全書》是淨明道的基本典籍。有關淨明教義、方術及主要傳人生平與活 動事跡具載於此。
卷二淨明道法文論：有題許遜撰《玉真靈寶壇記》，胡化俗即胡慧超述《淨明大道說》《淨明道法說》，郭璞述《淨明法說》、郭璞撰《玉真立壇疏》，皆 係劉玉創教期間，托稱眾真降授的文字。其中《淨明大道說》謂忠孝為大道之本，修道 貴在忠孝立本，方寸淨明，淨、明、忠、孝，四美俱備，不用修煉，自然道成。《淨明 道法說》稱無極清虛曰淨明，欲治其外，先正其內，欲正其內，先去其欲，元欲而心自 正，心正則道法備。
卷三至五劉玉語錄：計七十五條，每卷二十五條。以問答形式寫成，為劉玉向 弟子傳教之言論匯集。如卷三《玉真先生語錄內集》，為淨明忠孝教義的語錄。劉玉稱 “淨明隻是正心誠意，忠孝隻是扶植綱常”。謂真忠至孝之道，可概括為三十字：“懲 忿窒慾，明理不昧心天；纖毫失度，即招黑暗之愆；霎頃邪言，必犯禁空之醜”。學道 者由真忠至孝，可複歸本淨元明之境。又謂世人若能以孝道二字常蘊在方寸內，則言必 忠信，行必篤敬，忿消欲寡，改過遷善，方備人道。淨明忠孝，人人分內皆有，學為人 之道，當忠君孝親，奉先淑後。修淨明道者，須先除淨胸腹間魑魅魍魎。如卷四《玉真 先生語錄外集》，為淨明道法的語錄。劉玉謂雷霆一陰一陽，其源實出先天之道，誅擊 世間不孝惡物；
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