順便說一下，種子與細心，本來是兩個東西，但後來唯識學者根據經義，很巧妙地將這兩種思想結合起來，構成了唯識學說的重要理論，並奠定了唯識義理的深厚基礎。
從公元三、四世紀起，大乘唯識學開始在印度形成、建立，並迅速發展起來。到了六至七世紀唯識學發展到了鼎盛時期。大乘唯識思想的發展大致經歷了以下三個階段。
經典時代的唯識學，唯識學所依據的大乘經典有六部，即：《解深密經》、《大方廣佛華嚴經》、《如來出現功德經》、《大乘阿毗達磨經》、《楞伽經》、《厚嚴經》。其中最根本、最重要的是《解深密經》，它是唯識學的正依。唯識學的主要思想和核心理論在這部經中都基本上提到了。如：在間斷的六識外，確立了阿賴耶識的存在，作為輪迴的主體；在種識現起一切的思想下，確立了唯識無境的原理；在“一切法相品”和“無自性相品”中，提出了唯識的重要理論－－三性、三無性等。唯識學是依三性，即遍計所執性、依他起性和圓成實性來抉擇一切法，並認為說一切法皆空是不了義，隻有遍計所執性是空的，依他起性和圓成實性都是有的。可以說《解深密經》基本上奠定了唯識學的理論基礎，是唯識學最主要的經典依據。《大方廣佛華嚴經》、《楞伽經》、《厚嚴經》都不是純粹的唯識的思想，同時包含瞭如來藏的思想在內。《如來出現功德經》、《大乘阿毗達磨經》在華夏都沒有譯本。
論典時代的唯識學，此時的唯識思想主要是指彌勒學、無著學和世親學，這是唯識學逐步確立和完善的重要時期。在此需要對大乘唯識學產生的思想和時代背景作一簡要的說明。眾所周知，唯識學是在龍樹大乘中觀學之後產生的，此時己是佛滅七百年後，隨著性空思想的逐漸衰落，印度大乘佛教出現了很多問題，對龍樹空義思想產生了種種誤解，甚至出現了“惡取空”，否定一切的極端傾向。與此同時，秘密的“如來藏我”思想也很突出，專說一乘，不可避免的含有神我之意。在這種情況下，佛滅九百年後，無著、世親兩大論師，繼承、發展了彌勒之學，廣造經論，大力弘揚大乘唯識學，其目的就是為了糾正當時人們的錯誤知見，讓佛法走入正道。而此時已是佛在《阿含經》中所預言的“佛滅五百年後有諸相似偽寶出於世間，偽寶出已，真寶則沒”的像法時期了。
彌勒菩薩被認為是唯識學的開山祖師，但嚴格來說，彌勒的思想並不限於唯識。彌勒的唯識學是由無著傳出的，一般認為，彌勒就是在兜率內院的一生補處菩薩，也就是當來人間的未來佛。但也有人認為是當時真實的歷史人物。漢傳的彌勒五論是：《瑜伽師地論》、《大乘莊嚴論頌》、《分別瑜伽論》、《金剛般若論頌》、《辨中邊論頌》。藏傳沒有《分別瑜伽論》、《金剛般若論頌》，與之相應的是《現觀莊嚴論頌》和《辨法法性論》，共同具有的三部論是《瑜伽師地論》、《大乘莊嚴論頌》、《辨中邊論頌》。其中，《瑜伽師地論》被公認是唯識學的根本論典。
無著論師。傳說他曾上升兜率天向彌勒菩薩請法，學習《瑜伽師地論》，對唯識學的創立與發展作出了巨大的貢獻。無著的主要論典有：《顯揚聖教論》、《攝大乘論》、《阿毗達磨集論》等。其中，《顯揚聖教論》可以說是《瑜伽師地論》的大綱；《攝大乘論》是建立唯識理論的核心，對阿賴耶識和三性等問題作了詳盡的說明與論證，本論是解釋《大乘阿毗達磨經》的，被認為是無著的代表作品；《阿毗達磨集論》是建立唯識法相的重要論典。
世親論師是無著論師的弟弟，曾大力宣揚小乘教義，後受其兄影響，信受大乘，廣造經論，弘揚大乘唯識學。他將唯識學說加以嚴密組織，使之係統化、條理化，可以說是唯識學的集大成者。世親論師的主要的唯識論著有：《百法明門論》、《唯識二十頌》、《唯識三十頌》、《辨中邊論釋》等，其中《唯識三十頌》是按照唯識相、唯識性、唯識位的次第，配合境、行、果的修學程式，建立了嚴密的組織，是世親晚年一部具有代表性和總結性的唯識學著作。在完成了《唯識三十頌》後，世親論師本來打算為頌文再寫一部釋論，可惜這個願望沒有實現就去世了，因此這個任務就留給了後來的唯識論師們了。
儘管無著與世親一脈相承，但他們的思想還是有很大的差異。世親的思想比較複雜，對阿賴耶識和如來藏兩大體係都有很深的造詣，而在無著的論著中卻很難找到有關如來藏和佛性等思想。此外，我們還可以從《攝大乘論》和《唯識三十頌》看出兩家唯識思想的主要差異：關於“能變識”，世親是立三能變，即阿賴耶識、末那識、前六識都是能變識，重在以現行識來說明賴耶受熏持種、末那為執藏等唯識義。無著則隻立“一能變”，對阿賴耶識是重在種子識的說明。
唯識學所依據的十一論是：《瑜伽師地論》、《顯揚聖教論》、《大乘莊嚴論》、《集量論》、《攝大乘論》、《十地經論》、《分別瑜伽論》、《觀所緣緣論》、《唯識二十頌》、《辨中邊論》、《阿毗達磨集論》，其中，以《瑜伽師地論》為正依。該論共分為五分：本地分、攝抉擇分、攝釋分、攝異門分、攝事分，具體說明瑜伽師所行的十七地。其中，又以“本地分”最為根本，心、意、識、八識、種子與熏習、轉依等重要理論和思想在“本地分”中都很明白地說到了。本論提出了證明阿賴耶識存在的八大理由，即執受證、初受生證、明瞭證、種子證、業用證、身受證、無心定證、命終證。又以四相建立流轉、一相建立還滅，於流轉四相中，明確提出末那識說，從而完成了八識唯識說的思想體係。
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