16世紀日本戰國時期，伊賀地區形成三大上忍家族：百地家，首領百地丹波守在1581年第一次伊賀之亂中運用遊擊戰術擊敗織田信雄部隊，但在同年第二次伊賀之亂時遭遇織田信長大軍圍剿，最終全軍覆沒。
服部家，初代服部半藏保長原為室町幕府武士，後投效德川家康家族，其子正成憑借戰功位列德川十六神將，開創服部半藏世襲稱號。
藤林家，成員藤林保武編纂的《萬川集海》係統整合忍術理論與實戰技巧，成為江戶時代最具影響力的忍者教科書。
成為上忍需滿足三重標準：累積重大軍功提升家族聲望，具備戰略決策與資源整合能力，掌握高階忍術知識體係。
晉升資格僅向特定家族開放，普通忍者無論功績多高都無法突破階級限製。這種嚴格的世襲製度導致多數上忍家族在江戶時代後期隨著戰爭減少而逐漸衰落。
中忍是日本忍者階級中的中層人員，負責實戰指揮和戰鬥小隊領導工作，忍術水平較高。日本戰國時代是中忍活動的盛行時期，他們效力於各地大名，執行情報收集、刺殺等間諜任務，並負責戰鬥小隊的現場指揮。德川幕府時期，中忍被納入正式編製，其職能得到官方認可。中忍所屬的流派以伊賀和甲賀為主，使用手裏劍、苦無等特殊武器，並遵循陰忍和陽忍的忍術規範。
忍者階級分為上忍、中忍和下忍，其中中忍在戰國時代承擔戰鬥指揮職責，服務於大名並執行隱蔽任務。德川幕府時期，中忍被納入幕府正式編製。
中忍作為戰鬥小隊現場指揮官，需具備高超忍術和敏捷行動能力，以避免任務中被捕。他們遵循忍術規範，主要從事間諜活動，具體分為陰忍和陽忍兩類，負責實際對戰的指揮工作。
中忍所屬流派以伊賀、甲賀最為知名，使用手裏劍、苦無、鎖鐮等特殊武器。深藍或深紫色服飾便於中忍在夜間隱匿行蹤。
下忍是日本江戶時代正式使用稱謂的忍者階級，屬於忍者組織中的底層執行者。其曆史可追溯至飛鳥時代的“誌能便”，奈良時代改稱“斥候”，戰國時期武田信玄將其命名為“亂波”，至江戶時代正式采用“忍者”名稱。該階級主要負責執行前線作戰任務，經典形象包括黑衣裝束、暗器使用。
戰國時代忍者多為雇傭兵，德川家康通過“伊賀穿越”事件收編伊賀忍者組成伊賀同心軍團，由服部半藏統領。江戶時代忍者逐漸轉型為“同心”參與治安管理，並在佩裏叩關事件中執行末代間諜任務。隨著幕府戰敗，忍者職業逐漸消亡，最終融入普通民眾生活。
下忍是日本忍者階級中的底層等級，負責執行具體的戰鬥、偵察、暗殺等前線任務。曆史上，下忍在奈良時代曾稱“斥候”，指負責偵察敵情的士兵。
忍者的意思最初是指執行“秘密任務的人”，這個詞最早在日本的江戶時代就有了。忍術盛行在日本戰國時代，當時爭權奪利的諸侯及軍閥迫切需要培養專業化的滲透部隊執行間諜任務。德川幕府時代，忍者被納入正式編製，進入最興盛的年代。
江戶幕府統一日本後，長期的和平使忍者逐漸失去了存在價值，加上幕府對忍者集團采取的消滅措施，忍者漸漸式微。隨著17世紀中葉德川幕府的消亡，日本忍者失去了雇主，忍者也就難以作為職業存在了。
下忍是忍者等級製度中的底層階級，通常與中忍、上忍共同構成三級結構。下忍主要負責執行具體的前線任務，如偵察、刺探、暗殺、擾亂及破壞等。
在裝備上，下忍的標準服裝為深藍色或深紅色的夜行服，常用武器包括手裏劍、忍刀、飛鏢等小型多功能武器。訓練方麵，下忍注重精神修煉，並需掌握輕功、夜視能力等特殊技能，以適應秘密行動的需求。
忍者通常在新月或陰天夜晚潛入敵方城樓與宅邸，如果總是全身黑色裝束，輪廓反而會更顯突出，因此，經常的基本裝束顏色是深藍。碰到月明星稀的夜晚，便換成灰色或是茶色裝束。
至於內褲，當然是日本傳統的兜襠布。隻是，忍者的束法同一般人不同，長度也比較長。他們將兜襠布從脖子纏到胯下，最後綁在腰際。如此，可以隨時從脖子後抽出兜襠布，當做繃帶或繩子應急。上衣裏頭有許多口袋，放一些不能淋濕的火藥、縫衣針、救急藥包括安眠藥、毒藥等；腰帶裏頭則放一些日用雜物。手套與綁腿，通常藏著一些暗器。
為了矇混國境關卡守關人員的審問，忍者在旅途中，經常是農夫打扮。因此，有些忍者暗器，經常是改造自農具、日常必需用品、園丁道具等。這些武器，大多是自己發明鑄造，隻有自己深知其用法，因而在旁人眼裏看來，跟一般日用品沒什麽分別。這也是很多忍者武器失傳的主要原因之一。
忍者的武器很多都是來自日常的農具，而且用法和外形都非常古怪。根據曆史描述，忍者經常使用尾部栓有鐵鏈的鐮刀，平時作戰時可以握著鐮刀柄近身作戰，也可以利用鐵鏈將鐮刀甩出刺殺對手，並利用鐵鏈收迴。德川家康的衛隊就是伊賀忍者。他們假扮園丁，使用大的修枝剪修剪枝條。一旦看見有人來，他們會立即監視，一旦發現對方有不軌企圖，就將對方置於死地。
現代人從各種忍術秘本中，所得知的忍術武器有：撒菱、忍刀、吹矢、忍杖、手甲鉤、水蜘蛛、弓箭、苦無、聞金、坪錐、問外等。
“撒菱”，又稱十字釘，是逃走時撒在身後的一種菱形武器；凡是凹凸不平，能夠刺傷雙足的東西，例如天然石頭、幹燥果實、鐵器等，都可以拿來代用。
“忍刀”，很鈍，附有一條長約三米的繩子，翻越城牆時，可以當踏腳工具，再利用繩子收迴；刀鞘，臨危時可以當潛在水中的通氣管。
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