於是二神返迴高天原去請教眾天神，為何會生下怪胎？天神用焚燒鹿肩骨的占卜方法為二神占卜後說道：“那是由於女子先發話的緣故。女子先說話不吉利。這次迴去由男子先說，再重新來一遍。”
再次結緣：於是伊邪那岐命與伊邪那美命迴到淤能棋呂島，照以前的方法又重新繞柱走了一遍。這次二神相遇時，伊邪那岐命首先說道：“好一位美麗的女子！”緊接著伊邪那美命才說道：“好一位英俊的男子！”
重新舉行了結婚儀式後，二神生得八島：淡路島；伊豫島，此島一身生有四個麵孔，每個麵孔各有一個名字；隱岐島；築紫島，此島也是一身四麵，每個麵孔各有一個名字；伊伎島；對馬島；佐渡島和大倭豐秋津島。此八島又稱作“大八島國”。此後又生得六個小島，共計十四個島。伊邪那岐命與伊邪那美命共同創造的這片國土，又稱葦原中國，是相對於高天原天上的世界和黃泉國地下的世界而存在的人間的世界。
生完國土又生育諸神。房屋神、河神、海神、農業神、風神、原野神、山神、船神、火神等，共計生得三十五位神。最後在生火神火之夜藝速男又名火之炫毗古神，火之迦具土神時，伊邪那美命被嚴重燒傷，期間她的嘔吐物、糞便也分別化為幾位神。不就後伊邪那美命便因重傷不治死去了。
分開別離：伊邪那美命因生火神而被燒傷，不久便離開這個世界，到黃泉國去了。
男神伊邪那岐命失去了愛妻，悲傷萬分。他撲在妻子的屍身上哭泣道：“我的愛妻呀！為了那麽個小子竟失去了你，實在是太不值得了！”男神哭泣時流出的眼淚化作泣澤女神。
男神把伊邪那美命安葬於出雲國和伯耆國交界的比婆山下後，拔出腰間所佩的十拳劍，將致使伊邪那美命命歸黃泉的火神的頭砍了下來，沾在劍尖、劍身、劍柄等處的血流下後，化出八位山神。被砍掉了腦袋的火神火之迦具土神的頭、胸、腹、陰部、左右手、左右腳也分別化作了山神、雨神、武器神等八位神。
伊邪那岐命思念著伊邪那美命，便隨後追到黃泉國，想把伊邪那美命帶迴來。伊邪那美命自緊閉的黃泉國大殿的大石門內迎出來，伊邪那岐命對女神說道：“我親愛的妻子啊，我們共同創造的國土尚未完成，無論如何請隨我迴到世上來吧。”
女神迴答說：“太遺憾了，你怎麽不早點來接我呢？我已經吃了黃泉國的飯食，無法返迴你所在的世界了。不過，既然你特地來接我，我也願意迴去啊。讓我去與黃泉國的眾神商量一下，看能不能隨你迴去。但是，在此期間你不許偷看。”
說完，伊邪那美命返身迴到大殿中去，伊邪那岐命則等候在石門外。等了許久，仍然不見女神出來，伊邪那岐命漸漸焦躁起來，按捺不住，便取下插在左耳鬢的多齒木梳，將它的最粗一齒折斷，點上火製成火把，舉著它悄悄進入大殿。借著火光仔細一看，隻見伊邪那美命身上爬滿了蛆，頭部、胸部、腹部已經嚴重潰爛，全身由大雷到伏雷共八個雷神環繞。伊邪那岐命見了驚恐萬分，拔腿而逃。伊邪那美命被丈夫看到了醜陋的形象，惱羞成怒，立即派黃泉女鬼去追。女鬼很快便要追上了，伊邪那岐命急中生智，把自己頭上戴的黑木藤編的藤圈朝身後扔去，那藤圈即刻化作一片野葡萄林。女鬼嘴饞貪吃野葡萄，伊邪那岐命便趁機跑遠了。女鬼吃了野葡萄，又緊追上來。這次伊邪那岐命取下插在右耳鬢的木梳，將梳子齒掰斷扔向身後，刹時身後長出鮮筍。在女鬼貪吃鮮筍之際，伊邪那岐命又跑遠了。最後，由伊邪那美命身體各部分生成的八雷神，率領黃泉國的魔軍追殺而來，伊邪那岐命拔出佩在腰間的十拳劍抵擋，邊揮舞邊逃，魔軍直追到黃泉國與葦原中國的分界處黃泉比良阪。伊邪那岐命從長在比良阪山坡下的桃樹上摘下三個桃子，朝追來的魔軍擲去，沒想到魔軍見了桃一下子便潰不成軍，四散而逃。伊邪那岐命感激地對桃子說：“謝謝你們幫助了我。今後，生活在葦原中國的人們若身處困境，還請多幫助他們。”說完，封桃子為“意富加牟亞美命”。自此凡間流傳著桃木可避邪的說法。
伊邪那美命見幾次追殺都失敗了，便親自追來。伊邪那岐命推來一塊大石頭，喚作千引石，擋在比良阪的路中，將黃泉國與葦原中國間的道路堵死。伊邪那美命無法繼續前行，隔著大石頭憤憤地說道：“我的夫君，你既然如此對我，我將每天殺死一千名你的國人。”
伊邪那岐命答道：“我的妻子，你若這樣做，我就每天建一千五百個產房，每天誕生一千五百個嬰兒。”
因為這個緣故，每天都有一千人死去，每天又都有一千五百人誕生。而伊邪那美命則成了黃泉津大神。
三貴子誕生：伊邪那岐命迴到葦原中國後，覺得自己去了趟黃泉國，渾身沾滿了汙穢，便打算舉行祓濯儀式來去掉身上的汙穢之氣。
築紫國日向的橘小門的阿波岐原位於河的入海口處，岸邊桔樹葉青枝茂，陽光燦爛地照耀著，景色很美。伊邪那岐命來到這裏，把身上的衣裳和飾物統統扔掉，裸著全身，準備跳進河裏好好清洗一下。他所扔掉的手杖、腰帶、圍在腰下的裙裳、內褲、帽子以及戴在左手和右手上的玉鐲，分別化成不同的神，一共生成了十二位神。
伊邪那岐命裸著身子，站在河邊觀察水勢，他自言自語道：“上遊太湍急，下遊太舒緩，就在河的中段吧。”
於是，跳進河的中段，潛入水中，細致地洗濯全身。
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