針對K-mer演演算法是一種識別病原體基因組的演演算法基礎工具。
屬於基因重組中的重要技術。
基本上每一個涉及到基因重組的人員都會涉及其運用。
本科學生掌握工具的使用不難，但理解深層邏輯還有一定難度，更別提改良這種演演算法工具。
李澗的論文可以優化基因序列比對演演算法，提高病原體基因組的識別效率，加快基因組的資料分析速度，並作出詳細註釋。
大大縮短生物實驗的前期準備時間。
這種演演算法類的論文，不需要太多的資料支援，可以不用進行太多的實驗，取一部分先前兩個月時間內做過的實驗資料，就能夠滿足論文的資料支援。
（
最重要的還是涉及到數學以及程式設計演演算法方麵的編寫，這對於一個前世已經非常成熟的工具來說，非常的簡單。
隻需要將藍星的工具稍微削減一部分的功能之後，編寫出來即可。
涉及到的數學、計算機學的知識都不是很難。
李澗有了思路之後，很快沉浸在了論文的編寫過程之中。
通過對藍星的工具進行解析，獲取了許多先進的理念，對自身現有的學識不足，有了更深層次的瞭解。
特別是在數學計算以及計算機程式設計方麵，還有很大的缺陷。
核心程式碼放在麵前，都搞不懂其中所代表的意義。
「這是你寫的論文，怎麼會想到這個方向？雖然跟生物資訊學有一定關聯性，但更偏向於基因重組的方向。」
忽然，一個熟悉的聲音從身後響起。
李澗轉頭看過去，發現導師周靖學教授已經站在了自己的身後，不知道有多久的時間。
「對，老師……我最近的實驗已經完成了，所以就打算根據實驗獲取的資料，寫一篇論文，看看能不能投稿出去。」
李澗回答道。
他們現在還是大三下學期的學生，冇有確定畢業論文題目。
不過學校有一個規定，凡是投稿國內頂級期刊的論文或者各類競賽獲獎的論文都能夠作為畢業論文進行畢業答辯。
目前生物係專業的學科大學生競賽已經報名截止，就算可以保命，前身是一個學渣，在係裡也找不到隊友，冇辦法參賽。
剩下的路隻有學術期刊投稿了。
「你對基因重組技術很熟悉嗎？」
周靖學詢問道。
以本科階段的基因重組知識積累，暫時還做不到這種程度。
他很早就到了實驗室裡麵，原本隻是為了拿一樣生物材料，但看見李澗在認真的寫論文，忍不住湊過去看了幾眼。
這一看就被吸引住了。
冇想到自己這個剛剛招收的大三學生，竟然試圖改進病原微生物的基因組鑑定方法。
每一種全新的分析方法構建，都需要非常龐大的計算資源，以及長期大量的臨床檢驗場景的資料支援。
屬於一種繁瑣又精細的科研專案。
原本打算斥責一番。
但隨著對方寫論文的逐漸呈現出來，他竟然感覺到了一絲醍醐灌頂的錯覺。
這學生改進的演演算法從思路上看，並冇有什麼大問題。
甚至連模擬資料都跑出來了……
「嗯，老師，我最近做的基因重組實驗，正好運用到較多的BLAST，這種工具分析基因資料太過繁瑣了，大部分的實驗都用在了基因組的解析上麵。」
「所以我就有了一種想法，改進一下BLAST工具，創造一種更高效的分析工具。」
李澗回答道，這是他早就想好的說法。
不過為了堵住這個說法之中的漏洞，他最近需要好好的惡補一下數學跟程式設計方麵的知識。
「模擬資料看上去倒是冇有多大的問題，充當畢業論文足夠了，但那可就太可惜了。」
「如果補全臨床資料，徹底的驗證你論文模擬資料之中的結論正確可行的話，足以發表一篇頂刊。
你加我一下微信，回頭我將隔壁醫學院的同學推給你，你自己聯絡一下，溝通臨床研究的事情！」
周靖學拿出手機，開啟了微信掃一掃遞了過來。
李澗迅速的拿出手機開啟了微信，加上了好友。
「過程中遇到什麼問題都可以來找我，或者找程頤，他是我手底下的博士生，算是你們的大師兄。」
「不錯，好好努力，論文寫好了，我可以幫你看看。」
周靖學聽到了微信好友通過的提示音後，拍了拍李澗的肩膀，笑著說道，一改平常冷臉待人的模樣，變得十分的寬和。
原本不打算帶本科生了，但是學校那邊已經安排下來，他也冇有拒絕。
冇想到竟然遇到一個不錯的苗子。
根據李澗所寫的模擬資料來看，論文所改進的演演算法完全具備可行性。
從他對這份資料的處理來看，在基因重組方麵的知識比一些碩士研究生都要深入一些。
20分鐘路程
我一個人住.讓我們在我家見麵吧!
約嗎?
現有的BLAST生物大分子對比工具是大洋對麵的世界第一大國國家生物技術資訊中心研究出來的頂尖工具，目前市場上主流的生物大分子比對工具。
國內也有，但是相比BLAST的功能方麵還差了一些，還有很長的路要要追趕。
在臨床治療中分析病原微生物的工具，如果僅僅是已知的核酸測序的資料分析的話，大約十來分鐘就能夠搞定。
確定好病原體就能夠對症下藥。
但是如果是陌生未知的病原體，需要進行完整的基因庫建庫最少需要十多個小時。
其中涉及到測序、資料標準化註釋、功能性驗證、臨床關聯性分析、資料入庫等等工序，非常的複雜。
難一點的病原體甚至需要數天乃至上月的時間進行測序建庫工作。
比如前些年剛剛發現的病毒，就花費了好幾天的時間才確定完整的基因庫。
李澗的論文初稿之中提出的全新演演算法，就能夠將臨床之中的病原體檢測時間壓縮至兩個小時……這就有一點過於先進了。
足足壓縮了數倍的時間，可以改變無數人的人生。
拯救許多生命。
這是萬家生佛的一種創新。
雖然周靖學不太相信李澗的論文能夠成功完成。
但有想法是好事，值得鼓勵。
隻要去做，總會有收穫。
哪怕是錯誤的結果，論文寫不出來，也能夠給以後的實驗提供一些寶貴的經驗。
周靖學在實驗方麵非常的苛刻，但是並不會阻礙學生們自發的擴充套件實驗，甚至還會免費給他們提供實驗材料，幫忙分析資料。
李澗這孩子雖然才大三，平時成績基礎差了一點，卻冇想到能夠給他這麼一個驚喜。
原本因為在教務處看見李澗的成績所帶來的偏見，在此刻全部變成了驚喜。
「我知道了，老師，那我本科論文題目……。」
李澗聽到老師的提示，心中一驚。
這種簡單的論文，都能夠上一期頂級期刊嗎？就算是國內的期刊，也非常了不得。
可以給接下來的研究生麵試提供極大的幫助。
他隻是想水一篇畢業論文而已，為接下來的考研爭取一些寬鬆的學習時間。
冇想到還能夠釋出到頂級期刊上。
算是一個意外之喜。
現在看來，還是高估這個世界的生物研究水平了。