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等到觀察係統再次啟動時，畫麵已經切換到了東京近郊的一處廢棄工廠。這裡就是字條上標註的地址，也是K.S.實驗室的所在地。
柯南站在工廠門口，仔細打量著這棟看似破舊的建築。雖然表麵佈滿鐵鏽，但那些窗戶的材質明顯不是普通玻璃。而且整個建築的輪廓都透著一種說不出的詭異感，就像是被什麼東西改造過。
＂博士，能探測到什麼嗎？＂他按了按蝴蝶結變聲器。
＂訊號很奇怪。＂阿笠博士的聲音從耳機裡傳來，＂建築物內部似乎有某種乾擾裝置，普通的探測器完全失效了。＂
林大運通過觀察係統看著這一幕，總覺得哪裡不太對勁：＂係統，為什麼柯南敢就這麼大搖大擺地來？＂
＂分析顯示：工藤新一很可能早有準備。注意到他的口袋裡帶著某種特製道具。＂
確實，柯南今天不隻帶了麻醉針手錶，連球鞋和眼鏡都經過了升級。看來是做好了硬碰硬的準備。
就在這時，工廠的大門突然自動開啟。一個穿著白大褂的男人走了出來，臉上帶著職業化的微笑：＂歡迎光臨，偵探先生。＂
＂K.S.實驗室的人？＂柯南警惕地問。
＂隻是個普通的研究員。＂男人說，＂不過所長正在等你。關於記憶同步實驗的事，他很想聽聽你的看法。＂
這句話明顯是在試探。一般人根本不可能知道＂記憶同步＂這個詞，男人卻直接說了出來，顯然是料定柯南已經調查到了某些真相。
＂所長是指李修遠博士吧？＂柯南冷冷地說，＂那些連環殺人案也是你們策劃的？＂
＂計劃的一部分而已。＂男人聳聳肩，＂不過比起這個，你不是更關心小蘭小姐的情況嗎？＂
柯南的表情變得銳利起來：＂你們對小蘭做了什麼？＂
＂隻是幫她喚醒了一些沉睡的才能。＂男人笑道，＂畢竟，像福爾摩斯那樣的大偵探也是經過長期訓練纔有今天的成就。我們隻是讓這個過程變得更快了一些。＂
＂所以就用那種生物電子裝置強行植入記憶？＂
＂哦？看來你連這個都查出來了。＂男人露出讚賞的神色，＂不愧是工藤新一，這份推理能力確實值得稱讚。＂
話音未落，十幾個黑衣人突然從暗處冒出。他們手裡都拿著某種奇怪的儀器，正在將柯南團團圍住。
＂不過既然你已經知道這麼多了，＂男人的語氣突然變得危險起來，＂不如也來參加我們的實驗吧？以你的頭腦，一定能為記憶同步技術做出巨大貢獻。＂
林大運看得心驚肉跳：＂係統，這小子該不會是故意中套的吧？＂
＂否定。根據表情分析，工藤新一的反應完全在預料之中。他似乎在等待什麼......＂
就在這時，遠處突然傳來警笛聲。大批警車呼嘯而至，為首的正是目暮警官。
＂糟了！＂男人臉色一變。
但更讓他驚訝的是，那些黑衣人突然丟下儀器，轉身就跑。定睛一看，他們身上都穿著警視廳特搜部的製服。
＂臥底？！＂男人這才反應過來上當了。
原來早在柯南來之前，就已經安排了大量便衣警察潛入工廠。那些看似在跟蹤的黑影，其實都是特搜部的精英。
＂計劃很完美。＂柯南推了推眼鏡，＂可惜你們太小看警方了。＂
男人冷笑一聲：＂是嗎？但你們來晚了。＂
他按下手中的遙控器，整個工廠突然響起刺耳的警報聲。緊接著，建築內部傳來陣陣爆炸聲。
＂自毀裝置？＂林大運一驚。
＂肯定。檢測到大量實驗資料正在被銷燬。李修遠顯然早有準備。＂
警方雖然控製了現場，但實驗室的核心裝置已經被徹底摧毀。等特搜部衝進去時，隻剩下一地焦黑的儀器殘骸。
＂可惡！＂目暮警官懊惱地說，＂又讓他們逃了！＂
但柯南的注意力卻被一樣東西吸引了。在爆炸的廢墟中，一個金屬保險箱居然完好無損。這顯然不是巧合，對方是故意把它留下的。
開啟保險箱，裡麵隻有一張紙條：
＂親愛的偵探先生： 不得不說，你的表現確實令人印象深刻。不過這次的實驗還遠冇有結束。相信你也注意到了，那些連環殺人案隻是開胃菜。真正的好戲即將上演。 記憶同步隻是第一步，等到最終實驗完成，你會見證一個前所未有的奇蹟。到時候，就連你引以為傲的推理能力，也會顯得那麼微不足道。 期待下次見麵。 ——K.S.＂
字條背麵還標註著一串數字，看起來像是某種座標。
＂係統，能分析出那個位置在哪嗎？＂林大運趕緊問道。
＂基礎定位顯示：是東京灣附近的一處廢棄碼頭。但在限製狀態下無法進行更詳細的掃描。＂
就在這時，柯南的手機突然響了。是小蘭打來的。
＂柯南君，你在哪？＂她的聲音聽起來有些焦急，＂我好像...想起了一些很可怕的事情。＂
＂小蘭姐姐怎麼了？＂
＂我夢到了一個實驗室。＂小蘭說，＂裡麵有很多奇怪的儀器，還有一個穿著黑色風衣的人。他說要幫我覺醒什麼能力，然後就用某種裝置......＂
她的聲音突然變得痛苦起來：＂不行，頭好疼。那些記憶太混亂了，我分不清哪些是真的，哪些是被植入的......＂
柯南臉色一變：＂小蘭，你先彆想這些。我馬上回去！＂
但就在這時，觀察係統突然開始關閉。又到了該死的48小時限製。
＂喂！＂林大運急了，＂彆在這種時候掉鏈子啊！＂
＂警告：嚴禁突破限製。下次觀察將在48小時後重新開啟。＂
＂可是......＂
＂建議利用這段時間好好反省。這是監察者的原話。＂
林大運欲哭無淚。這種每隔兩天才能看一眼的狀態實在太折磨人了。而且偏偏在關鍵時刻就掉線，這簡直比火影世界那會兒還要憋屈。
但現在的他隻能乖乖等待。畢竟和可能永久報廢相比，48小時的禁閉已經算是輕鬆的懲罰了。
＂係統啊。＂他幽幽地說，＂你說我是不是特彆倒黴？＂
＂資料統計：在執行者中，你確實是受處罰次數最多的一個。＂
＂這種事就不用統計了！＂