一個月後，長治帝封唐耀東為前將軍兼車高總督，節製車騎、新會、充鱖、高臨四省軍事。薑同山為後將軍兼大吳總督，節製大邱、吳平、平都三省軍事。譚解民為護國將軍兼百皋總督，節製百澤、皋奚、弧羅三省軍事。申凡強為右將軍兼兩炳總督節製炳江、炳海、濟湖、丹朱四省軍務。
數日後，長治帝封梁曉武為英海總督監軍，詹仁義為欽差大臣赴雞崇巡察；新泰為車高總督監軍，嚴明為欽差大臣赴飛屏巡察；裘莽為大吳總督監軍，仲弘為欽差大臣赴孟襄巡察；沈桐為百皋總督監軍，邱奢為欽差大臣赴真光巡察；繆有為兩炳總督監軍，巫丹為欽差大臣赴中安巡察。
朝廷開國元勳隻剩下統帥部參軍大臣薑承德、方躍平、畢占文三人，方躍平因體弱多病，辭去行人院指揮使之職，僅保留參軍大臣一銜，且鮮少料理朝堂事務。畢占文患了重症，不能說話，根本不能行使職務，隻有薑承德體魄康健，卻遭到都察院禦史交章彈劾，日日有本參奏。
右都禦史夏晟奏本說道：“陛下，參軍大臣薑承德貪贓枉法，將海濱賑濟專用款揮霍一空，至今沒有交代出最終著落。這筆款項數目很大，說是沒有具體明細，分明是他私吞。望陛下下令查辦。”
吏部禦史夏幹成奏道：“薑承德幹涉地方總督行事，私下威脅兩炳總督申凡強，為其子薑燊謀得兩炳總督府軍師一職。其行為全然藐視皇權威嚴，竟越俎代庖，便是太上皇亦不敢如此直接越權。”
兵部禦史虎憑奏道：“薑承德幹涉皋奚用兵，越權指揮，不按大元帥先前製定下來的行動路線，致使洪壽江遇到皋奚左將軍臧銀寶主力阻擊，不能按時到達真光，險似將皋奚戰事引向失敗。”
左都僉禦史裴汝珍、大理寺丞施小國、國子監祭酒欣旭、百澤省禦史盧光、丹朱省禦史鹽宏、新會省禦史彡超、高臨省禦史鮮於政、充鱖省禦史苗慶等人都一致彈劾薑承德，薑承德無以招架，被迫辭職，持續一個多月的彈劾風波方纔落下帷幕。薑承德遭到彈劾的原因比較多，最主要的是他擺老資格，但常常被人抓住把柄；再者他又剛愎自用，聽不得他人意見；他老要說你說他，口沒遮攔，更為可笑的是經常在朝廷上竟然跟夫人枚香意見相左，大家都很看不慣，便專找他的岔子，雖長治帝有心留其於統帥部掛名任職，然其始終不甘賦閑。遭滿朝文武參奏，最終落得個淒涼下場。
一波才平，一波又起。左都禦史閻仟奏本：“斥候署對朝廷大臣搞斥候，弄得人人自危。滿朝文武大臣皆強烈取消斥候署。請皇上審思之。”他這一說，又是十幾個人跟著奏本。長治帝說道：“諸位，斥候署的設立宗旨是對付外來間諜的，你們說，不是有好多的間諜要刺殺朕的嗎？還曾有一次密謀投毒來殺朕的，所以不能說斥候署設立得不好，至於對自己人搞斥候，那是斥候署的人私自超權。”
斥候署樞密使先後換了八任：澹台偉、枚香、芮瓊芳、江蛟、祁凱、陶智、朱福仁、宋洋。長治帝因為朝廷大臣強烈抗議，隻好撤銷斥候署這一機構，另設偵辦處。
十天之後的早朝，左都禦史閻仟又出列奏本說道：“新建之偵辦處仍將群臣列為監察目標，滿朝文武較之往昔更添恐慌。此類機構必須裁減，永不設定。”
長治帝喝道：“大膽放肆！來人，將此人官帽摘除，偵辦處伺候！”隨即走上兩人一把抓住閻仟，當即摘掉其冠帶。閻仟大呼：“臣無罪，何故抓拿？”長治帝說：“閻仟，你聽著：你網羅私黨、揣測聖意、栽贓開國元勳薑承德、汙衊生事、圖謀不軌，惡意攻訐朝廷製度、旁敲側擊、挑釁朕之天威。這些罪名有憑有據，一旦坐實，死牢之囚，無可逃遁。推下去！”
閻仟被推了下去，長治帝隨即喊道：“將夏晟、夏幹成二人拿下！”隨即走上來四個兵士扭住二夏，二夏均大呼“冤枉”，長治帝大怒道：“你們二人朝議奏本均屬捏造，誣陷開國元勳，要挾皇上，實屬大逆不道。你們口口聲聲攻擊斥候署，而你們四處串聯，大肆活動，無所顧忌，不是謀反，還是什麽？哼！想威脅進而要挾朕，膽子也太大了。拉下去，偵辦處伺候，不得有誤！”
衛將軍繆有出列奏道：“陛下，都察院必須徹底改組，以閻仟、夏晟等人為主的都察院實際已經墮落為個人私情機構，他們這些人經常抱怨手中無實權，屢思兼領他職。陛下查辦他們這些人，實乃英明之舉，臣等萬死擁護！”